По поводу вопроса. Чаще всего дело в настройках соединителей у фитингов. Обычно классификация соединителя у отводов, тройников и подобных деталей — «Фитинг». И настроек у него негусто. Но если переключить классификацию на «Глобальный», то появится больше свойств, в том числе галочка «Разрешить регулирование уклона». 

Если поставить там галочку, а потом вернуть «Фитинг», то галочку вроде как не видно, но свойство уже изменилось, и Ревит это запомнил. В результате свойства нет, но оно активно и влияет на поведение труб при построении. В частности, если перемещать трубу, подключённую к такому фитингу, то фитинг не будет перемещаться за трубой, а будет изменяться угол соединения. В общем, получится вот такая вот поломка системы, как на скриншоте в вопросе.

Запомните: у фитингов не нужно ставить эту галочку, она никак не влияет на размещение фитингов в системах с уклоном.

Эта галочка нужна для семейств арматуры, оборудования и сантехники, у которых могут быть горизонтально ориентированные патрубки, из которых могут выходить трубы с уклоном. Например, унитаз с выпуском, параллельным полу, или какой-нибудь бак, к которому подключают трубу с жидкостью, и труба идёт под уклоном.